Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ror1Q9Z139 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ror1Q9Z139 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ror1Q9Z139 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms