Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Skp2Q9Z0Z3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skp2Q9Z0Z3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skp2Q9Z0Z3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skp2Q9Z0Z3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skp2Q9Z0Z3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skp2Q9Z0Z3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skp2Q9Z0Z3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skp2Q9Z0Z3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skp2Q9Z0Z3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skp2Q9Z0Z3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skp2Q9Z0Z3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skp2Q9Z0Z3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skp2Q9Z0Z3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skp2Q9Z0Z3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Skp2Q9Z0Z3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skp2Q9Z0Z3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skp2Q9Z0Z3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skp2Q9Z0Z3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skp2Q9Z0Z3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms