Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M6

Cd97, CD97 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd97Q9Z0M6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd97Q9Z0M6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd97Q9Z0M6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms