Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip2Q9Z0H8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip2Q9Z0H8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms