Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVS6

Prkn, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrknQ9WVS6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrknQ9WVS6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms