Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx1Q9WV80 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms