Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms