Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psma4Q9R1P0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psma4Q9R1P0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psma4Q9R1P0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psma4Q9R1P0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psma4Q9R1P0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psma4Q9R1P0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psma4Q9R1P0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psma4Q9R1P0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psma4Q9R1P0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psma4Q9R1P0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psma4Q9R1P0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psma4Q9R1P0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psma4Q9R1P0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psma4Q9R1P0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psma4Q9R1P0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psma4Q9R1P0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms