Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ntn3Q9R1A3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ntn3Q9R1A3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ntn3Q9R1A3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ntn3Q9R1A3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ntn3Q9R1A3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ntn3Q9R1A3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ntn3Q9R1A3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ntn3Q9R1A3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ntn3Q9R1A3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ntn3Q9R1A3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ntn3Q9R1A3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ntn3Q9R1A3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ntn3Q9R1A3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ntn3Q9R1A3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ntn3Q9R1A3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ntn3Q9R1A3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ntn3Q9R1A3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntn3Q9R1A3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms