Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vav3Q9R0C8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms