Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AmfrQ9R049 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms