Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc4Q9QZD4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms