Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Exo1Q9QZ11 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Exo1Q9QZ11 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms