Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tomm40Q9QYA2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tomm40Q9QYA2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 212.6 ms