Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trp53inp1Q9QXE4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms