Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt17Q9QWL7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt17Q9QWL7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms