Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH7

Neu3, Sialidase-3, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neu3Q9JMH7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neu3Q9JMH7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Neu3Q9JMH7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms