Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkain4Q9JMG4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkain4Q9JMG4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms