Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdc42ep4Q9JM96 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc42ep4Q9JM96 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms