Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot9Q9JKY0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms