Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx5Q9JKQ4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx5Q9JKQ4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms