Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zcchc17Q9ESX4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms