Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM6

Gdpd2, Glycerophosphoinositol inositolphosphodiesterase GDPD2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd2Q9ESM6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gdpd2Q9ESM6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gdpd2Q9ESM6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdpd2Q9ESM6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdpd2Q9ESM6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdpd2Q9ESM6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdpd2Q9ESM6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdpd2Q9ESM6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdpd2Q9ESM6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdpd2Q9ESM6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gdpd2Q9ESM6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gdpd2Q9ESM6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gdpd2Q9ESM6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms