Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chrnb2Q9ERK7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chrnb2Q9ERK7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms