Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CrotQ9DC50 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CrotQ9DC50 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CrotQ9DC50 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CrotQ9DC50 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CrotQ9DC50 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CrotQ9DC50 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CrotQ9DC50 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CrotQ9DC50 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms