Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc97Q9DBT3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms