Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9DAE8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9DAE8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9DAE8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9DAE8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DAE8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DAE8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DAE8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9DAE8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms