Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfrsf13cQ9D8D0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms