Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifi35Q9D8C4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms