Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tspan17Q9D7W4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms