Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d4aQ9D7V1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh2d4aQ9D7V1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d4aQ9D7V1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d4aQ9D7V1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms