Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930449I24RikQ9D5E3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms