Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al3Q9D4U4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms