Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms