Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930564D02RikQ9D4S4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms