Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc105Q9D4K7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms