Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pabpc6Q9D4E6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms