Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Hacd2Q9D3B1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hacd2Q9D3B1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms