Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Tmed11Q9D2R4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed11Q9D2R4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Tmed11Q9D2R4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Tmed11Q9D2R4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Tmed11Q9D2R4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Tmed11Q9D2R4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Tmed11Q9D2R4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed11Q9D2R4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms