Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D2Q3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D2Q3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D2Q3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D2Q3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D2Q3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D2Q3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D2Q3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D2Q3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D2Q3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D2Q3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D2Q3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D2Q3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D2Q3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D2Q3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D2Q3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D2Q3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9D2Q3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms