Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc8Q9D2H8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms