Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms