Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1I5

Mcee, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MceeQ9D1I5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MceeQ9D1I5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MceeQ9D1I5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MceeQ9D1I5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MceeQ9D1I5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MceeQ9D1I5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MceeQ9D1I5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MceeQ9D1I5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MceeQ9D1I5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MceeQ9D1I5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MceeQ9D1I5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MceeQ9D1I5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms