Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl53Q9D1H8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms