Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mrpl28Q9D1B9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms