Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hddc3Q9D114 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hddc3Q9D114 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hddc3Q9D114 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms