Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem53Q9D0Z3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms