Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrs1Q9CYH6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrs1Q9CYH6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rrs1Q9CYH6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrs1Q9CYH6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms