Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmem39aQ9CYC3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem39aQ9CYC3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms