Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mis12Q9CY25 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mis12Q9CY25 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms